示例:主动脉 H5¶
示例数据¶
/nas-data2/ryy/CMR4DFlow2026/Segdata/data4seg_test/h5s_autoflow/Aorta_Center003_GE_15T_Voyager_Exam32324-12224896-C17-0021.h5
这是 legacy complex H5:空间体数据、多个心动 phase、一个 magnitude 参考通道和三个复数速度编码通道。站点不会复制原始医学 H5;你需要在自己的环境中提供路径。

CLI 跑完整功能¶
CASE=/path/to/Aorta_Center003_GE_15T_Voyager_Exam32324-12224896-C17-0021.h5
autoflow-run "$CASE" \
--output-dir ./results/aorta_center003 \
--bgc \
--autoseg \
--with pwv,wss,pg,vortex \
--video plane,wss,pg,streamlines
这个命令依次完成加载、输入归一化、活动分割、骨架/图/路径/截面、基础截面指标,然后只运行你在 --with 和 --video 中请求的可选分析。
GUI 跑同一个病例¶
File > Open H5打开文件。- 在
Input & QC检查尺寸、方向、分辨率、VENC 和时间信息。 - 在
Segmentation选择分割来源,并在正交切面中检查边界。 - 依次运行
Skeleton、Graph/Paths、Planes。 - 在
Hemodynamics选择 PWV、WSS、压力或涡旋。 - 用
Export > Export Videos...导出截面、WSS、压力或流线视频。
输出目录¶
<output-root>/<case-name>/
├── summary.json
├── quality_report.json
├── planes.json
├── planes.h5
├── plane_positions.json
├── plane_metrics.json
├── plane_qc.json
├── pwv.json # 请求 PWV 时
├── *_wss*.npz / *_wss*.h5 # 请求 WSS 时
├── *_pressure*.npz / *.h5 # 请求压力时
└── *.mp4 # 请求视频时
先看 summary.json 确认哪些阶段真的执行,再看 quality_report.json 和 plane_qc.json,最后才解释数值。首页视频只是文档演示,不是临床报告。